由于具有耐腐蚀性，且维护成本较低，不锈钢成为上述两种海水淡化工厂的材料。
目前采用热蒸馏工艺的海水淡化工厂通常使用含钼的双相不锈钢，如2205和2304级不锈钢。除具有较强的耐腐蚀性外，双相不锈钢还有着很高的机械强度，这意味着它的建造用钢量更少，海水淡化工厂蒸发器的总密度和重量因此得以减少30%，从而提高了经济性。
采用反渗透工艺的海水淡化工厂则普遍通过使用含有6%钼的不锈钢和超级双相不锈钢（例如，以色列亚实基伦海水淡化工厂使用的是2507级不锈钢），也能够有效防止腐蚀。虽然海水淡化行业是中东地区保证饮用水供应的一大核心行业，但作为能源密集型行业，该行业碳足迹较大。不过，新型海水淡化创新技术或可帮助该行业变得更加绿色。
